Την αντίδραση και των Ανεξάρτητων Ελλήνων προκάλεσε η δήλωση του Υπουργού Παιδείας Νίκου Φίλη σχετικά με τη γενοκτονία των Ποντίων. Η εκπρόσωπος του κόμματος Μαρίνα Χρυσοβελώνη δήλωσε ότι οι Ανεξάρτητοι Έλληνες δεν υιοθετούν τις δηλώσεις του υπουργού και πρόσθεσε ότι “θεωρούμε ότι δεν έχουμε δικαίωμα να εκμηδενίσουμε τον σχεδιασμένο τραγικό ξεριζωμό χιλιάδων ανθρώπων οι οποίοι θυσιάστηκαν με βίαιο τρόπο. Η ιστορία του Πόντου ήταν και θα παραμείνει αδιαμφισβήτητα αληθινή”.